关于clusterData的报错

[littleacdemicwhite]

cm <- clusterData(obj = avereps_df, cluster.method = "mfuzz", cluster.num = 6)
[1] "0 genes excluded.\n"
错误于array(x, c(length(x), 1L), if (!is.null(names(x))) list(names(x), :
'data'的类型必需为向量，但现在是'NULL'

查验过average_df数据没有问题，请大佬解惑

[XIANZHE-LI]

我是更新到最新版出现这个问题

cm<- clusterData(obj = exp,

•              cluster.method = "mfuzz", #kmeans或mfuzz
  

•              cluster.num = k, #以10个聚类为例
  

•              seed= 12345678) #随机数种子
  

[1] "0 genes excluded.\n"
错误于array(x, c(length(x), 1L), if (!is.null(names(x))) list(names(x), :
'data'的类型必需为向量，但现在是'NULL'

[aptx10086]

在其他评论底下看到了原作者的回复，是因为最新版的ClusterGVis包更新了参数名，我有同样的问题，更改参数名之后就解决了。

[aptx10086]

原代码会报错：
ck<-clusterData(obj=mat,

•             cluster.method = "kmeans",
  

•             cluster.num = 5)
  

[1] "0 genes excluded.\n"
错误于array(x, c(length(x), 1L), if (!is.null(names(x))) list(names(x), :
'data'的类型必需为向量，但现在是'NULL'

但是更改参数后就正常了：

ck<-clusterData(obj=mat,

•             clusterMethod = "kmeans",
  

•             clusterNum = 5)
  

[1] "0 genes excluded.\n"